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全外顯子測序

全外顯子測序WES:是利用探針雜交富集外顯子區(qū)域的DNA序列,通過高通量測序,發(fā)現(xiàn)與蛋白質(zhì)功能變異相關(guān)遺傳突變的技術(shù)手段。相比于全基因組測序,外顯子組測序更高深度、更加經(jīng)濟。

技術(shù)優(yōu)勢

·直接對蛋白編碼序列進行測序,找出影響蛋白結(jié)構(gòu)的變異;

·高深度測序,可發(fā)現(xiàn)常見變異、低頻變異及罕見變異;

·針對外顯子組區(qū)域測序,約占基因組的1%,有效降低費用,周期和工作量。

服務(wù)流程

樣本要求

樣本類型

樣本要求

保存及運輸條件

說明內(nèi)容

新鮮組織

1.新鮮組織標(biāo)本(腫瘤樣本在術(shù)后30分鐘內(nèi)取得)≥50 mg(黃豆粒大小),-80℃直接長期凍存,-20℃可保存2-3個月。

2.穿刺樣本:腫瘤組織長度≥1cm,2-3條;所有新鮮組織標(biāo)本要求未壞死腫瘤組織比例在 70%以上;必須首先進行常規(guī)病理診斷,可于-80℃直接長期凍存,-20℃可保存2-3個月。

干冰運輸

 

白片/蠟卷

1.切片厚度 3-5μm,5-10張(組織≥1×1 cm2)或10-20張(組織<1×1 cm2)切片;白片置于切片盒中。

2.蠟卷:直接置于1.5 mL無菌離心管中。

常溫保存和運輸

 

蠟卷應(yīng)保證組織含量充足;盡量送檢一年以內(nèi)的石蠟標(biāo)本。

外周血(DNA

1.EDTA抗凝管采集(紫色):4-5 mL靜脈血,4℃保存,4-6小時內(nèi)分離血漿,分離后血漿不少于2 mL。

2.Streck管采集樣本:4-5 mL靜脈血,常溫可存儲72 h,分離后血漿不少于2 mL。

1.EDTA抗凝管采集的血液,經(jīng)分離血漿后,48h 內(nèi)送達,可使用足量冰袋,用泡沫箱運輸;超過48 h,使用干冰運輸。2.Streck管采集的血液,72 h內(nèi)送達,常溫運輸,注意避免劇烈震蕩。

收樣后立刻提取或-80℃暫存。

外周血(cfDNA

1.EDTA抗凝管采集(紫色):4-5 mL靜脈血;4℃保存,4-6小時內(nèi)分離血漿,分離后血漿不少于原體積一半;分離后的血漿在-20℃冰箱最多可保存一周。

2.Streck 管:4-5 mL靜脈血,分離后血漿不少于原體積一半,常溫可存儲72h。

1.EDTA抗凝管采集的血液,經(jīng)分離血漿后,48 h內(nèi)送達,可使用足量冰袋,用泡沫箱運輸;超過48 h,使用干冰運輸。2.Streck管采集的血液,72 h內(nèi)送達,常溫運輸,注意避免劇烈震蕩。

收樣后立刻提取。

gDNAFFPEDNA

基因組DNA用TE溶解;總量≥6 μg;純度OD260/280在1.8-2.0之間;濃度≥50 ng/μL。

使用1.5 mL或2 mL離心管盛放,用parafilm 封口膜密封,然后將樣本管置于保護用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子。使用足量冰袋,用泡沫箱運輸。

若要求使用特定某種品牌的外顯子捕獲試劑盒,請?zhí)貏e指明。若樣本為非人類來源的其他物種,請?zhí)貏e指明。

 

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