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16S擴(kuò)增子測序
16S擴(kuò)增子測序是對特定長度的PCR產(chǎn)物或捕獲的片段進(jìn)行測序,分析序列中的變異。即通過提取環(huán)境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴(kuò)增16S目標(biāo)區(qū)域,通過檢測目標(biāo)區(qū)域的序列變異和豐度,以研究環(huán)境微生物多樣性及群落組成差異。
技術(shù)優(yōu)勢
· 讀長長,周期短,性價比高;
· 專業(yè)成熟的樣本制備、建庫以及數(shù)據(jù)分析流程,客觀還原樣品本身的菌群結(jié)構(gòu)以及豐度;
· 可以同時對樣品中的優(yōu)勢物種、稀有物種以及一些未知的物種進(jìn)行檢測,獲得樣品中的微生物群落組成以及它們之間的相對豐度;
· 適用于微生物多樣性對于研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用等方面的研究。
服務(wù)流程
樣本要求
樣本類型 |
樣本要求 |
保存及運(yùn)輸條件 |
說明內(nèi)容 |
糞便 水體 土壤 淤泥/沉積物 |
糞便:3-5g; 土壤:10g; 血液:10 mL; 淤泥/沉積物:5-10g。 |
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DNA | PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用TE溶解;總量≥2 μg;純度OD260/280在1.8-2.0之間;濃度≥50 ng/μL。 |
使用1.5 mL或2 mL離心管盛放,用parafilm封口膜密封,然后將樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子。使用足量冰袋,用泡沫箱運(yùn)輸。 |
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物須經(jīng)適當(dāng)純化,不含有客戶不想測序的非特異性條帶、殘留的引物或引物二聚體。 |
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